Som sagt har Daniel och Oskars grupp idag försökt fastställa huruvida olika växter de samlat in innehåller en viss gen. Vi tänkte vi skulle förklara lite mer i detalj hur det går till. Vi letar alltså efter en viss gen och gener definieras utifrån de kvävebaser i DNA-strängarna som de består av. Vår gen, kallad RTE1, innehåller följande kvävebassekvens:
ataaacaacc aaaggttcat tgtacctttc tccattgtct tcaatgaatt cctaaaacta gaagaagcgt tactttagaa aaccaattat aaaaatctcc tctttcttca tcaaattcca caaagcatca gtttcttctc cttctccaag ctctcgcatc actttcatcg atttttcctc tctgcgtcga tccttcagac atcggcgtcg gagtttccga caggaatcta aaaatgtcac gtggaagagg agttcctatg atggacctga aacgaagtta tgatgttgaa gacagggtgg tgtccgtgtc tataccatca ataatcgaag ctgatgaggc tgatctgtgg ccactacctg agattgatac caagaagtcg aaatttcctt gctgtatagt ttggactcct cttcctgttg tctcttggtt ggctcctttc attggtcata ttggactttg cagagaagat ggagtcattt tggactttgc tggatctaac ttcatcaatg ttgatgattt tgcatttggt cctcctgctc gctatctcca actcgataga accaagtgtt gcttaccacc aaatatgggt ggacatactt gcaagtatgg attcaaacac accgactttg gaacagcgcg tacatgggat aatgcactga gctcgagcac acgtagcttt gagcataaaa cctacaacat cttcacttgt aactgccatt cgtttgttgc aaactgtttg aaccgtcttt gctatggtgg ctcaatggag tggaatatgg tgaatgttgc tattttactt atgatcaaag ggaaatggat caatggttca tcagtagtcc gctcgtttct gccatgtgct gtggtcacgt ctttgggggt ggtgcttgtc ggctggccat tcctcatcgg tctctcttcg ttctcgctac tactctttgc ctggttcata attgctactt actgttttaa gaacataatt acttgaagca gtatgagaga aatataaata tgatgtatca ccaaaattat gttaatctta agaattgttc tcttt
Vad man gör sedan är att man tar en bit av en växt och finfördelar den. Sedan separerar man DNA:t från växtdelarna genom att dels behandla det med olika kemikalier och sedan centrifugera det.
Sedan kör vi en process som kallas Polymerase Chain Reaction (PCR). Genom att använda en så kallad primer kan vi bestämma vilka delar av det DNA vi samlat in som vi replikerar. Om den gen vi söker finns i den växt i analyserar kommer PCR processen leda till att vi kopierar denna gen massor med gånger. I eftermiddag skall vi se reslutatet, förhoppningsvis har vi hittat något intressant!
